进入石室禅院，看到的第一座建筑物，便是石室禅院的山门。山门一般是对寺院的称呼，指的是寺院正面的楼门。因为以前寺院多筑于山林之间，故以山门为寺院的别名。设山门的目的，不仅在于彰显道场的神圣庄严，器宇不凡，更重要的是为了避开市井尘俗的喧嚣，远离名利场中的种种欲望，保持佛门清净无染的形象。

石室禅院的山门，分为外山门和内三门。外山门为仿印度阿育王石柱建成的石雕山门（牌坊式的建筑），四根石柱是佛陀四圣地的阿育王石柱（现为印度国徽），代表佛陀的诞生、成道、转法轮、入涅槃。每根石柱顶上，各有四尊狮子，面朝四方，威风八面。正面石柱上刻着本寺住持忠明法师撰写的一副对联：“石磬灵山圣境金桂沁心幽静禅，室馨药师道场玉兰飘香证果院。”背面石柱对联为：“阿育王立狮柱扬菩萨道遍百千国土，三归岭建道场修药师法度万亿众生”。

外山门的两边，各放一尊袒胸露乳、笑口常开的金色弥勒佛像，左边一尊手持如意，右边一尊手持金元宝，寓意进山信众吉祥如意、招福纳财。踏入山门，迎面而来的，便是石雕五百罗汉，尊尊形象各异，体态百般，栩栩如生，立于道路两旁，夹道欢迎八方香客。五百罗汉为五百阿罗汉的略称﹐意为已经证得阿罗汉果位的五百位声闻，被认为是“断尽烦恼，堪受世间供养之圣者”。关于五百罗汉的来历﹐在佛教中有多种说法：一是如《十诵律》中载，佛陀在世时，常有五百弟子随侍听法传道。一是在佛陀涅槃后，参加第一次结集或第四次结集的五百比丘。在《舍利弗问经》中又说，弗沙秘多罗王毁灭佛法后，有五百罗汉重兴圣教。中国汉地佛教尊崇五百罗汉是从五代时开始的。当时，吴越王钱氏在天台山方广寺造五百铜罗汉。显德元年（954年），道潜禅师在杭州净慈寺创建了五百罗汉堂。宋太宗雍熙二年（985年），造罗汉像五百一十六身（十六罗汉与五百罗汉）奉安于天台山寿昌寺，从此各地大寺院多建五百罗汉堂。南宋绍光四年（1134年）工部郎高道素所录乾明院罗汉石刻，将五百罗汉一一起名造姓，此后，凡寺院建五百罗汉堂，皆援用其名。